奇门遁甲的流派很多，运用方式也各有侧重，按不同的方式可以分为不同的种类。
一、从功能用途分类
从功能用途上，可分为“法术奇门”、“数理奇门”。数理奇门与法术奇门在这两类奇门类别中，应用最多的是数理奇门，而法术奇门因其带有太多的神秘色彩，所以流传不是很广。
1、 “法术奇门”侧重于玄学符令的应用，久已失传。
法术奇门是将奇门与道家法术相结合，夹杂了许多神秘和虚妄的东西。其主要代表作是《六阴洞微真经》。奇门法术包含了奇门内部诸多的密术秘法，这些密术秘法以其神奇的效应，将人们的潜能挥发到了某种极限。修炼奇门中的法术，必须具备以下条件：一是道行深厚；二是心术纯正；三是舍得付出；四是尊师重道；五是严守门规；六是积功累德。法术奇门有3600个法门，这些法门中又分大小法门，而大小法门中又分上中下三等法术。常用的奇门法术的类型主要有护身法、收元神法、制邪术法、与人互斗法、驱魂散离法、索债法、阴坛用符咒法、发兵将法、急难突围法、扭转乾坤法、六甲阴符法、伏匿藏形法、真人步斗法、禳除疫病法、三奇神咒法、五鬼驱魂法、五鬼搜魂法等等。
2、“数理奇门”有“方位奇门”和“占卜奇门”二类，使用率比较高。
数理奇门主要是应用式盘来预测，其主要代表作是《烟波钓叟歌》。数理奇门巧妙地将象数与五行两种术数体系融合在一起，其天、地、人、神盘及三奇六仪，各有所代表之象与数，又有各自的五行属性和生杀关系。其中信息纵横成网，故可以迅速、准确、完整地描述时空中天、地、人事的前因后果、所有状态。奇门式盘是基于洛书九宫为骨架而建立起来的，洛书九宫是后天象数的描述语言，所以，奇门遁甲从表观而论，蕴涵象数之实。三奇六仪即天干，是五行术的基本结构。在奇门式盘中，地支亦分布于九宫之中，成为时间信息和方位信息的刻度表。所以，天干地支均被纳入奇门体系中，五行术的判断原则也就可以随之应用于其中了。
二、从布局方式上分类
从布局方式上，按时间可以可分为“年家奇门”、“月家奇门”、“日家奇门”、“时家奇门”等常见流派。
1、年家奇门
年家奇门是以60年为一元，也就是以60年为一局，分为上元、中元、下元，三元共计180年。年家奇门的定局起法是以上元甲子年起坎一宫，中元甲子年起巽四宫，下元甲子年起兑七宫，相当于时家奇门依节气而起定局。但由于天道左旋，所以年家奇门均为阴遁局，依阴遁之法，要逆布六仪，顺布三奇。年家奇门盘定局之后，先看当年的年干和年支是什么，再去寻它的旬头，在盘上依旬头看直符、直使是什么，然后据此转动活盘，直符随年干，直使随年支。吉凶的判断和时家奇门的方法一样。年家奇门主要在定局，也就是每年都是从几宫起甲子，然后才能逆布六仪，顺布三奇。一般来说，年家奇门是从黄帝有熊氏即位的甲子年作为年家奇门上元开始推算。另外，年家奇门还配有另一套九星，即一白、二黑、三碧、四绿、五黄、六白、七赤、八白、九紫。年家奇门配九星的法则是以上元甲子一白入中宫，中元甲子四绿入中宫，下元甲子七赤入中宫，其他各中则按九星的次序和九宫的顺序顺布。
2、月家奇门
月家奇门是五年一局，也就是五年一元，也分为上、中、下三元。每年十二个月，五年正好六十个月，所以五年为一元。月家奇门的分元是年支遇寅、申、巳、亥四孟为上元，在坎一宫起甲毛年支遇子、午、卯、酉四仲为中元，在巽四宫起甲子;年支遇辰、戌、丑、未四季为下元，在兑七宫起甲子。实际上，月家奇门的分元与时家奇门秋分节气的上、中、下三元完全相同。月家奇门的布局法是先从年干推出月干，月的干支都明确后，再寻出它的旬头，据旬头找出直符、直使，直符随地盘月干，直使随地盘月支飞泊，定局之后，得奇得门之方大利。月家奇门也配年家奇门九星，配九星的法则是由年定的，入中宫的九星为：孟年正月二黑，仲年正月八白，季年正月五黄，星顺月逆而布。
3、日家奇门
日家奇门比时家奇门要简单，其局数只有120个。它与时家奇门相同的地方有以下四点：一是以九宫八卦为排盘的构架;二是都分阳遁和阴遁，冬至到夏至前为阳遁，夏至到冬至前为阴遁;三是都用休、生、伤、杜、景、死、惊、开八门;四是都忌五不遇时。不同的地方有以下五点：一是排局方法不同;二是九星不同;三是日家奇门没有时家奇门的几十个吉凶格;四是日家奇门分十二黑黄道，时家奇门不分;五是日家奇门论喜神方位，时家奇门则没有。日家奇门排八门之法，首先是得日辰而定休门在哪一富，然后依三日一换宫，冬至后用阳遁，夏至后用阴遁;以及依据日干之阴阳，而作顺布或逆布法则。日家奇门的九星是太乙、摄提、轩辕、招摇、天符、青龙、咸池、太阴、天乙。排九星首先要确定太乙在哪一宫，然后依次排其他八星，其中九星有一星是入中宫的。另外，日家奇门有十二黑黄道，预示本日内十二个时辰的吉凶。还有就是确定每El的喜神方位，以及由日干来推定天乙贵人、截路空亡和五不遇时等。
4、时家奇门
时家奇门是一个时辰一个格局，按奇门历法，每年冬至上元至第二年冬至上元为一个循环，总共是360日，每天12个时辰，那么全年的总局数就是4320局，但在这4320局中，实际上每一局重复了四次，所以全年时辰的格局类型总共是1080局。在这1080局中，要受节气和日干所制，一个节气分为上元、中元、下元这三元，一元一局，共分为阳遁九局和阴遁九局;从冬至开始到芒种结束为阳遁;从夏至开始到大雪结束为阴遁。其中阴、阳遁各540种。在时家奇门排盘时，分为天、地、人、神四盘，依时辰而转动天盘、人盘和神盘。
5、小结
“年家奇门”以年为主布局，“月家奇门”以月为主布局，“日家奇门”以日为主布局。“时家奇门”以具体时间来布局，使用范围最广。“年家奇门”和“月家奇门”只用阴局，“日家奇门”和“时家奇门”阴阳局都用。
三、从盘式推演方法分类
奇门遁甲是由天盘、地盘、人 盘和神盘按照时间规律运转构成，有点类似于模拟地球在宇宙中的运转规律。
从盘式上，可分为“转盘（活盘）奇门”和“飞盘奇门”，或者是排宫法和飞宫法两类。
“转盘奇门”和“飞盘奇 门”分属两个不同的流派，是两种不同的布局方法。两种演局方法得出的结论基本 一致，不同的是步骤和方式。
“转盘奇门”
比较正式，是依照天体运转的规律去排盘、演局的，实际是对天体进行模拟。
“飞盘奇门”
是模拟气流 磁场的变化，按照九宫格的跳动，从1宫跳到9宫进行排盘、演 局，实际是感应气流磁场的规律。
四、从起局方式上分类
从起局方式上，可分为“置闰法”、“拆补法”和“茅山道人法”。
五、除此之外还有其他划分法。
各大流派在断局方式上也有不同，有的用神比较灵活，有的用神比较固定。
